1、加快构建新型农业经营体系研究,周应恒(主持)、杜志雄、耿献辉、胡浩、潘显政、严斌剑、应瑞瑶,国家社科基金重大项目,2014-2017;
2、环境保护、食品安全与农业生产服务体系,应瑞瑶(主持)、,国家社科基金重大项目,2011/11-2014/12;
3、新农村建设与农业经营方式转变,何军(主持)、应瑞瑶 刘华 林光华 周力,中央高校基本业务费,2012/06-2014/09;
4、建设以低碳排放为特征的农业产业体系及农产品消费模式研究,胡浩(主持)、周应恒 应瑞瑶 张广胜 安玉发 苗齐 ,国家社科基金重大项目,2010/12-2013/12;
5、畜禽养殖业温室气体减排的生产补偿机制研究——以太湖流域为例,周力(主持)、应瑞瑶 杨军 曹历娟 纪月清 潘丹,教育部人文社会科学基金青年项目,2011/01-2013/12;
6、畜禽低碳养殖的生态补偿机制研究--基于产地转移的视角(20100097120009),周力(主持)、应瑞瑶 杨军 曹历娟 纪月清 潘丹,教育部博士点基金,2011/01-2013/12;
7、农业科技创新与推广服务体系研究,应瑞瑶(主持)、周宏、林光华、周力,江苏省软科学专项,2012-2013;
8、江苏省农民专业合作社绩效评价研究,应瑞瑶(主持)、,江苏省农业委员会,2012-2013;
9、农业生产经营方式转型的理论与实践,应瑞瑶(主持)、何军,江苏省高校人文社科项目,2011-2013;
10、中国农业生产率再测算及其影响因素:资源环境约束的视角,应瑞瑶(主持)、林光华、潘丹,教育部人文社科基金,2011-2013;
11、农产品国际贸易,朱晶(主持)、周应恒 应瑞瑶 苗齐 耿献辉 曹历娟 周力,江苏省高校“青蓝工程”科技创新团队,2010/12—2013/12;
12、江苏省现代农业发展的财政支持政策研究,应瑞瑶(主持)、,江苏省财政厅,2010/05-2010/12;
13、江苏省农民专业合作社发展的财政支持政策研究,应瑞瑶(主持)、,江苏省财政厅,2010/05-2010/12;
14、需求变化背景下的农业推广服务体系改革问题研究,应瑞瑶(主持)、林光华 周 力,江苏省软科学项目,2009/06-2010/06;
15、现代农业发展战略研究,周应恒(主持)、钟甫宁 王凯, 周曙东,朱晶,应瑞瑶,曾寅初,安玉发,胡浩,国家教育部人文社科研究重大课题招标项目,2007-2010;
16、金融危机对农民工就业行业影响调查,应瑞瑶(主持)、何军 林光华,农业部软科学项目,2009/05-2009/12;
17、合作社法实施后江苏省农民专业合作组织发展对策研究,应瑞瑶(主持)、,江苏省农林厅,2007-2008;
18、江苏省现代农业发展保障体系研究,应瑞瑶(主持)、,江苏省科学技术学会,2007-2008;
19、南京农村新型合作经济组织发展实证研究,应瑞瑶(主持)、,南京市软科学招标项目,2006-2007;
20、畜产品供应链垂直协作关系研究——从农户角度,应瑞瑶(主持)、戴迎春 罗英姿 韩纪琴,国家自然科学基金,2005-2007;
21、从消费者收益角度对中国食品质量安全政策绩效进行的实证及量化分析 ,周应恒(主持)、应瑞瑶 何军,国家自然科学基金,2004/01-2006/12;
22、江苏社会主义新农村建设与指标体系研究,曲福田 周应恒(主持)、应瑞瑶 宣亚南 何军等,江苏省委宣传部、江苏省哲学社科重点项目,2006/01-2006/08;
23、江苏省农村专业合作组织发展现状及运行机制,应瑞瑶(主持)、,江苏省社科基金项目,2005/07-2006/06;
24、南京发展农村股份合作经济的理论与实践研究,应瑞瑶(主持)、,南京市软科学一般项目,2005/09-2006/06;
25、“国际经济与贸易”专业品牌专业建设,李岳云(主持)、应瑞瑶 宣亚南等,江苏省教育厅,2003-2006;
26、南京市品牌农业发展战略研究,应瑞瑶(主持)、,南京市农林局,2005/01-2005/12;
27、江苏现代农业产业发展研究,周应恒(主持)、宣亚南 应瑞瑶 王树进 许朗,省委农工办,2005/03-2005/10;
28、大学生就业与经管类课程教学法改革,张晓蓉(主持)、应瑞瑶,经管院,2004/06-2005/06;
29、江苏省科型中小企业创业投资公司试点计划,钟甫宁 褚保金(主持)、应瑞瑶 潘军昌 周月书,横向,2004/05-2005/01;
30、江苏省农民专业合作组织运行机制及发展对策,应瑞瑶(主持)、,江苏省农林厅,2004-2005;
31、南京市地方财政支持农民专业合作组织发展对策研究,应瑞瑶(主持)、,南京市农业资源区划办公室,2004-2005;
32、多元化新型农业技术服务体系制度创新研究,应瑞瑶(主持)、,江苏省软科学,2004-2005;
33、食品质量安全的风险控制及管理体系构建研究,周应恒(主持)、应瑞瑶 胡浩 ,教育部博士点基金,2003/01-2004/12;
34、城乡统筹发展化解“三农”难题的思路与对策,李岳云(主持)、应瑞瑶 冯继康 高瑛等,国家发改委“十一五”招标课题 ,2003/11-2004/05;
35、南京市实施城乡统筹发展的思路与对策研究,李岳云(主持)、陈勇 应瑞瑶 孙林等, 南京市科技局招标课题,2003/06-2004/05;
36、创业投资的外部环境与内部机制研究,钟甫宁(主持)、褚保金 应瑞瑶 潘军昌 刘晓玲,教育部人文社会科学研究项目,2002-2004;
37、政府农业管理改革研究,欧名豪(主持)、宣亚南 应瑞瑶,江苏省政府专项,2003/01-2003/12;
38、我国食品质量安全的风险控制与管理体系研究,周应恒(主持)、应瑞瑶 胡浩,农业部软科学,2003/04-2003/12;
39、江苏省观光农业资源开发的技术经济研究,顾焕章 应瑞瑶(主持)、,省资源开发局,2001-2002;
40、民营农业科技型企业运行机制研究,禇保金 应瑞瑶(主持)、,农业部软科学,2001-2002;
41、南京市乡村旅游的发展模式及对策研究,应瑞瑶 李太平 (主持)、,南京市软科学一般项目,2001-2002;
42、江苏省风险投资机制研究,应瑞瑶(主持)、,江苏省社科基金项目,2001-2002;